1.福州港

位于中國大陸東南部，台灣海峽西岸，由河口港與海港組成。福州港是中國沿海主要港口之一和綜合運輸體系的重要樞紐，是福州市及閩江流域發展外向型經濟和連接國際市場的重要支撐，是福建省對台"三通"的重要口岸。

2.江陰港

位于福清市江陰半島，福建省最大海灣——興化灣北岸中部，是未來福建省對外經濟發展的重要基地。未來的江陰港，必将成為海西樞紐港。

3.泉州港

泉州市東南晉江下遊濱海的港灣，北至湄洲灣内澳，南至泉州圍頭灣同安區蓮河，海岸線總長421公裡。泉州港被譽稱為“世界最大貿易港”之一而馳名中外，與埃及亞曆山大港齊名。

4.廈門港

地處上海與廣州之間，福建省東南的金門灣内，九龍江入海口，面向東海，瀕臨台灣海峽，與台灣、澎湖列島隔水相望，為我國東南海疆之要津，入閩之門戶。開港于1843年，分為内港和外港兩部分，主要擔負廈門市和福建省内外貿運輸任務，也承擔江西省某些物資的中轉任務。

5.肖厝港

位于福建省泉州市湄洲灣南岸，水域遼闊，面積516平方公裡。港區主航道水深10-20米，5萬噸級船舶可自由進出。肖厝港所在的泉港區是福建省石化基地，也是國家規劃建設的6大石化基地和四大國際中轉港口之一。

6.湄洲灣

位于福建省東海岸的中部，莆田市仙遊縣和泉州市泉港區兩地交界處，分屬莆田市和泉州市，與台灣基隆港隔海相望，是閩台兩省相距最近而又最大的一對姊妹港。湄洲灣秀嶼港台灣海峽兩岸人流、貨流的重要口岸，也是福建省重點開發建設的三大重點港口之一。